本发明公开了一种去除核糖体RNA的反转录引物池、试剂盒及去除核糖体RNA的方法;该反转录引物池的序列如SEQ ID NO:1~10所示;该试剂盒包含上述反转录引物池,本发明利用原核生物共有的rRNA序列,设计不同密度覆盖的反转录引物,根据具体需要去除的RNA中本身的rRNA序列的差异,进行特异性的反转录,从而得到与目标RNA完全反向互补的cDNA序列,再通过后续的RNase H和DNase I特异性消化杂合链的rRNA和cDNA,最终去除核糖体RNA;该方法能够搭配建库试剂盒,最终得到浓度足够高的转录组文库,从而有效实现转录组测序在基础研究、临床诊断和药物研发等领域的广泛应用。
本发明公开了一种去除核糖体RNA的反转录引物池、试剂盒及去除核糖体RNA的方法;该反转录引物池的序列如SEQ ID NO:1~8所示;该试剂盒包含上述反转录引物池,本发明利用植物共有的rRNA序列,设计不同密度覆盖的反转录引物,根据具体需要去除的RNA中本身的rRNA序列的差异,进行特异性的反转录,从而得到与目标RNA完全反向互补的cDNA序列,再通过后续的RNase H和DNase I特异性消化杂合链的rRNA和cDNA,最终去除核糖体RNA;该方法能够搭配建库试剂盒,最终得到浓度足够高的转录组文库,从而有效实现转录组测序在基础研究、临床诊断和药物研发等领域的广泛应用。
本发明公开了一种去除核糖体RNA的反转录引物池、试剂盒及去除核糖体RNA的方法;该反转录引物池的序列如SEQ ID NO:1~21所示;该试剂盒包含上述反转录引物池,本发明利用真核生物共有的rRNA序列,设计不同密度覆盖的反转录引物,根据具体需要去除的RNA中本身的rRNA序列的差异,进行特异性的反转录,从而得到与目标RNA完全反向互补的cDNA序列,再通过后续的RNase H和DNase I特异性消化杂合链的rRNA和cDNA,最终去除核糖体RNA;该方法能够搭配建库试剂盒,最终得到浓度足够高的转录组文库,从而有效实现转录组测序在基础研究、临床诊断和药物研发等领域的广泛应用。
本发明提供了一种反转录引物,其由RNA模板互补部分和人为引入的错配部分组成。在具体实施方案中,所述反转录引物的序列为SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:10、和/或SEQ ID NO:14。本发明还提供了设计所述反转录引物的方法。通过在RT‑PCR中使用这种引物,可以特异性扩增RNA,而不会扩增相同序列的DNA。